اهداف انجمن عبارتند از:
الف : کلیات
ارتقای فرهنگ، دانش و ساختار اهدای عضو درکشور، بهبود بقای اعضای اهدا شده و حمایت از خانواده های اهداکننده.
ب: روش اجرای اهداف
- آموزش اهدای عضو به تیم های درمانی و جامعه.
- ارتقای فرهنگ اهدای عضو و حمایت از خانواده های اهداکننده.
- ارتقای دانش مسئولین و پرسنل واحدهای فراهم آوری اعضای پیوندی در همه زمینه های اهدای عضو.
- ارتقا دانش کلیه رشته های پزشکی و پیراپزشکی درباره مرگ مغزی و اهدای عضو با هماهنگی و اخذ مجوز از وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی.
- ارتقا دانش کلیه سطوح جامعه درباره مرگ مغزی و اهدای عضو.
- دسترسی راحت بیماران نیازمند به پیوند اعضا به ارگان های پیوندی و بهبود بقای اعضای اهدا شده.
- آموزش و نحوه شناسایی کامل افراد مرگ مغزی.
- ایجاد عدالت و مساوات در تخصیص ارگان های پیوندی.
- کمک به ایجاد شبکه تخصیص عضو کشوری، انتقال ارگان ها و نسوج بین مراکز مختلف کشور.
- ایجاد خودکفایی در کشور و کاهش نیاز به ارجاع بیماران برای پیوند اعضا و نسوج به سایر کشورها.
- رسیدگی به مشکلات خانواده های اهداکننده عضو افراد مرگ مغزی.
- همراه نمودن خیرین.
- ایجاد تعامل و تعاون بین سازمان های دولتی و غیر دولتی ذیربط.
- جذب نیروهای متخصص و متبحر در هر کدام از شاخه های ذکر شده (کوردیناتوری، پرستاری، فرهنگی، مددکاری و...) به عنوان اعضای گروه.
- حمایت از طرح های پژوهشی مرتبط با اهدای عضو.
- کمک به ارائه ی مشاوره ها و خدمات مورد نیاز پس از راه اندازی مراکز.
موافقت مرجع صدور پروانه با انجام فعالیت های مذکور در اهداف و شیوه های اجرایی، به معنای اجازه فعالیت در خصوص مواردی که نیازمند کسب مجوز از دستگاه های خاص می باشد نیست.
بدیهی است انجام هرگونه اقدام در راستای اجرایی نمودن مواردی از اهداف و شیوه های اجرایی که مستلزم اخذ موافقت دستگاه خاص باشد، منوط به دریافت مجوز از آن مرجع است.